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Temps passé de l’infection à la maladie et l’infectiosité pour la maladie à virus Ebola, un examen systématique

Nous avons systématiquement revu la littérature pour estimer l’incubation et les périodes latentes de la maladie à virus Ebola. Nous avons trouvé des données épidémiologiques limitées chez les individus ayant une exposition discrète. Les données disponibles suggèrent que les périodes d’incubation et de latence peuvent différer et les modèles mathématiques peuvent être améliorés. deux périodes

Ébola, période d’incubation, période de latence, transmission, revue systématique L’épidémie actuelle d’Ebola en Afrique de l’Ouest est sans précédent en taille et en portée géographique De nombreux modèles mathématiques ont été développés pour capter la dynamique de transmission et l’impact potentiel des interventions. sur les principales caractéristiques épidémiologiques de la maladie à virus Ebola, et la plupart des paramètres de modélisation proviennent de modèles antérieurs ou de rapports empiriques uniques ; ceux-ci comprennent le temps écoulé entre l’infection et la période d’incubation des symptômes, le temps écoulé entre l’infection et l’apparition de la période latente d’infectiosité et la durée de l’infectiosité. Nous avons systématiquement examiné la littérature sur les épidémies d’Ebola.

Méthodes

Définitions

Période infectieuse

Après les Centres américains de contrôle et de prévention des maladies et l’Organisation mondiale de la santé, qui signalent que la transmission du virus Ebola se produit principalement par contact direct avec les sécrétions infectées, nous avons défini la période infectieuse EVD comme la durée de l’un des symptômes suivants: , diarrhée, toux ou hémorragie Nous avons supposé que la période infectieuse se terminait après la disparition des symptômes humides ou au moment du décès, et nous n’avons pas tenu compte de la transmission post-mortem.

Période d’incubation

Nous avons défini la période d’incubation comme le délai entre l’exposition au virus Ebola et l’apparition de symptômes EVD dans un cas probable ou confirmé. En plus des symptômes humides, nous avons observé des symptômes secs tels que fièvre, myalgie, céphalées, lésions oropharyngées, nausées, douleurs abdominales. et éruption

Periode de latence

Nous avons défini la période de latence comme le temps écoulé entre l’exposition au virus Ebola et l’apparition de symptômes humides dans un cas de MVE probable ou confirmé car peu de sources ont fourni une estimation directe de cette période, nous avons également considéré la somme de la période d’incubation. des symptômes secs à humides

Sélection d’étude

Panel supplémentaire Nous avons examiné tous les titres et résumés identifiés dans les bases de données spécifiées, à l’exclusion des articles qui n’ont pas rapporté de données primaires sur l’incubation. ou périodes latentes de MVE chez les humains Nous avons effectué des revues en texte intégral des articles restants en extrayant des informations sur les périodes d’incubation et latentes et le délai entre l’apparition des symptômes secs et humides. Parmi les sous-ensembles d’articles contenant des informations sur la chronologie des symptômes humides, nous avons également extrait la période infectieuse. Nous avons considéré uniquement les études qui fournissaient une définition claire des cas de MVE et des informations sur le type et le calendrier des expositions au virus Ebola. d’un événement de transmission n’est pas connue des expositions de plusieurs jours, nous avons inclus Seules les données provenant d’individus exposés à une seule journée

Analyses statistiques

Le cas échéant, nous ajustons une distribution normale aux estimations ponctuelles extraites de la littérature, pondérées par la fréquence d’observation. Nous avons calculé la période de latence en additionnant la période d’incubation moyenne et le temps moyen à partir du début. des symptômes secs à humides Nous avons calculé la variance de cette valeur composite comme la somme des variancesNous avons effectué une analyse de sensibilité dans laquelle nous avons inclus des publications fournissant des estimations de la période d’incubation basée sur des expositions de plusieurs jours ou des durées non spécifiées. effectué une analyse de sensibilité de la période infectieuse dans laquelle nous avons considéré que l’infectiosité a pris fin avec la résolution de la virémie plasmatique

RÉSULTATS

Après avoir examiné les titres et les résumés des citations répondant à nos critères de recherche, nous avons exclu les citations ne contenant pas de données primaires sur la transmission ou les symptômes cliniques de MVE chez les humains et les citations pour lesquelles les résumés ou les textes intégraux ne pouvaient être trouvés. Nous avons exclu le détail des citations restantes, comme nous l’avons détaillé dans les publications supplémentaires du Tableau 10: période d’incubation, période de latence signalée et temps écoulé entre l’apparition des symptômes secs et l’apparition des symptômes humides Tableau Nous n’avons pas pu quantifier l’hétérogénéité parce que la majorité des publications n’ont pas signalé la variance du paramètre

ue ± SD, jours N Emond et al Porton Down, Angleterre Non spécifié Ebola virus du Zaïre ou Ebola virus du Soudan inféré Fièvre de l’aiguille, douleurs abdominales centrales, nausées Diarrhée, vomissements ± N / A Richards et al Gabon / Johannesburg, RSA Zaïre ebolavirus inféré Accompagnement dans le CVC Fièvre Hématémèse, méléna ± N / A Période latente moyenne Période de latence Référence Lieu de la flambée Année Espèce Type d’exposition Symptômes initiaux Humidité initiale Symptômes Valeur ± SD, jours N Emond et al Porton Down, Angleterre Non spécifié Zaïre Ebola ou Ebola Soudan inféré Fièvre hémorragique, douleur abdominale centrale, nausée Diarrhée, vomissement ± N / A Richards et al Gabon / Johannesburg, RSA Ebola virus du Zaïre inféré Assisté dans le placement CVC Fièvre Hématémèse, méléna ± N / A Période latente moyenne Symptômes secs à mouillés Référence Lieu de l’éclosion Année Année Espèce Symptômes initiaux Humidité initiale Symptômes Valeur ± SD, jours N Commission internationale; Isaacson et al .; Sureau et al [,,] Zaïre Zaïre ebolavirus Fièvre, céphalée Hématémèse ± N / A Sureau et al Zaïre Zaïre Ebola virus inféré Fièvre, douleur généralisée, vomissement Vomissement ± N / A Sureau et al Zaïre Zaïre Ebola virus inféré Fièvre, lombaire douleur, vomissements Vomissements ± N / A Emond et al Porton Down, Angleterre Non spécifié Ebola virus du Zaïre ou Ebola virus du Soudan inféré Fièvre, douleur abdominale centrale, nausée Diarrhée, vomissement ± N / A OMS / International Study Team Sud-Soudan Non spécifié Fièvre, maux de tête, douleurs thoraciques Epistaxis, diarrhée sanglante ± N / A Richards et al Gabon / Johannesburg, RSA Ebola virus du Zaïre inféré Hématémie, méléna ± N / A Shoemaker et al Ouganda Soudan ebolavirus Céphalée légère Vomissements ± N / A Kreuels et al Sierra Leone Zaïre ebolavirus Malaise, mal de tête, myalgie, arthralgie Vomissements, diarrhée non sanglante ± so Lyon et al Monrovia, Libéria Zaïre ebolavirus Fièvre, fatigue, nausée Diarrhée, méléna ± N / A Lyon et al Monrovia, Liberia Zaïre virus Ebola Fièvre, fatigue, malaise Diarrhée ± N / A Wolf et al Sierra Leone Zaïre Ebola Fièvre, diarrhée Diarrhée ± N / A Lopaz et al Espagne Zaïre ebolavirus Fièvre, malaise Vomissements, diarrhée ± N / A Délai d’apparition des symptômes secs à humidesa ± Délai d’apparition des symptômes secs à mouillés Référence Lieu de l’éclosion Année Espèce Symptômes initiaux Humidité initiale Symptômes Valeur ± SD, jours N Commission internationale; Isaacson et al .; Sureau et al [,,] Zaïre Zaïre ebolavirus Fièvre, céphalée Hématémèse ± N / A Sureau et al Zaïre Zaïre Ebola virus inféré Fièvre, douleur généralisée, vomissement Vomissement ± N / A Sureau et al Zaïre Zaïre Ebola virus inféré Fièvre, lombaire douleur, vomissements Vomissements ± N / A Emond et al Porton Down, Angleterre Non spécifié Ebola virus du Zaïre ou Ebola virus du Soudan inféré Fièvre, douleur abdominale centrale, nausée Diarrhée, vomissement ± N / A OMS / International Study Team Sud-Soudan Non spécifié Fièvre, maux de tête, douleurs thoraciques Epistaxis, diarrhée sanglante ± N / A Richards et al Gabon / Johannesburg, RSA Ebola virus du Zaïre inféré Hématémie, méléna ± N / A Shoemaker et al Ouganda Soudan ebolavirus Céphalée légère Vomissements ± N / A Kreuels et al Sierra Leone Zaïre ebolavirus Malaise, mal de tête, myalgie, arthralgie Vomissements, diarrhée non sanglante ± so Lyon et al Monrovia, Libéria Zaïre ebolavirus Fièvre, fatigue, nausée Diarrhée, méléna ± N / A Lyon et al Monrovia, Liberia Zaïre virus Ebola Fièvre, fatigue, malaise Diarrhée ± N / A Wolf et al Sierra Leone Zaïre Ebola Fièvre, diarrhée Diarrhée ± N / A Lopaz et al Espagne Zaïre ebolavirus Fièvre, malaise Vomissements, diarrhée ± N / A Temps moyen d’apparition des symptômes secs à humidesa ± Abréviations: CVC, cathéter veineux central; RDC, République démocratique du Congo; TS, travailleur de la santé; N / A, non applicable; RSA, République d’Afrique du Sud; SD, écart-type; OMS, Organisation mondiale de la Santéa Les valeurs des paramètres combinés ont été ajustées à la distribution normale et pondérées par la fréquence d’observationVue LargeLa période d’incubation moyenne était de ± jours pour toutes les voies de transmission n = Tableau Les publications sur la période d’incubation après transmission percutanée ont donné une moyenne de ± n = et la transmission de personne à personne suivante ou le contact avec des animaux infectés a donné une moyenne de ± jours n = La moyenne de la période de latence chez les patients individuels était Tableau Le temps moyen entre l’apparition des symptômes secs et humides était de ± jours n = Lorsque nous avons additionné cette moyenne avec le temps d’exposition à l’apparition des symptômes secs, nous avons estimé une période latente moyenne de ± jours. Stratifiés par type d’exposition, nous avons calculé une période latente moyenne de ± jours après l’exposition percutanée, et ± jours après non percutanée. exposition D’après les publications qui ont rapporté la durée des symptômes humides, nous avons calculé une période infectieuse moyenne de ± jours pour les survivants de la MVE n = et un délai moyen entre l’apparition des symptômes humides et la mort de ± jours n =, la figure supplémentaire du tableau résume ces résultats

Figure Vue largeTélécharger le diaporamaStandard vs périodes proposées pour la maladie à virus Ebola aSource: ; Figure View largeTélécharger slideTemps standard vs périodes proposées pour la maladie à virus Ebola aSource: L’analyse de sensibilité de la période d’incubation incluait des publications couvrant un patient supplémentaire en raison d’expositions de plusieurs jours n =, type d’exposition non spécifié n =, ou période non déclarée n = La période d’incubation moyenne pour toutes les voies de transmission était de ± jours n = et la période moyenne d’incubation non percutanée était de ± n = de la période infectieuse, y compris les publications rapportant le délai entre l’apparition des symptômes humides et la résolution de la virémie plasmatique. Le tableau supplémentaire a révélé une période infectieuse moyenne de ± jours chez les survivants de la MVE n =

DISCUSSION

Nous avons trouvé des données limitées sur les individus ayant une exposition discrète pour estimer l’incubation et les périodes latentes de la maladie à virus Ebola. Un rapport sur la première épidémie connue d’Ebola a donné une période d’incubation de plusieurs jours. En revanche, les études qui répondaient à nos critères d’inclusion fournissaient un support pour une période d’incubation moyenne de plusieurs jours à plusieurs jours. Il est important de noter que les erreurs types que nous signalons sont des mesures d’incertitude dans l’estimation ponctuelle de chaque moyenne de population. Les erreurs-types ne doivent pas être utilisées pour déduire la durée optimale de la quarantaine pendant une épidémie d’Ebola. De nombreuses études de modélisation supposent que la période de latence EVD est égale à sa période d’incubation. Les études examinées ici suggèrent que les symptômes secs précèdent les symptômes humides d’une moyenne de quelques jours. Cela signifie que la période d’incubation sous-estime probablement le temps d’infection. Plus important, cependant, sont nos résultats sur la période infectieuse de la maladie d’Alzheimer Les périodes infectieuses utilisées dans de nombreux modèles proviennent de données empiriques limitées [-,], estimations ajustées des modèles antérieurs , ou reposaient sur des modèles qui estimaient des intervalles périodiques plutôt que des périodes infectieuses Si ces estimations reposaient sur des données empiriques sur l’apparition de tout symptôme jusqu’à la mort ou le rétablissement clinique, les périodes infectieuses peuvent Les critères d’inclusion stricts représentent une source potentielle de biais de sélection La période d’incubation moyenne estimée dans notre analyse de sensibilité était plus longue que celle estimée dans notre analyse primaire, conformément à notre prévision que les rapports sur les expositions de plusieurs jours surestiment la période d’incubation. biais peut introduire une classification erronée du moment de l’exposition à la MVE et de la période d’incubation L’hypothèse selon laquelle le virus Ebola est uniquement transmis par des patients présentant des symptômes humides peut sous-estimer la période d’infection si le virus Ebola peut être transmis par des vecteurs passifs, des gouttelettes ou des aérosols. quand ils ont des symptômes secs La transmission postmortem Ebola est également bien reconnue, et donc la durée de la période infectieuse est probablement sous-estimée pour les personnes décédées. Lorsque nous considérons que la fin de l’infectiosité est la résolution de la virémie plasmatique, cette analyse de sensibilité En résumé, nous démontrons que les données épidémiologiques limitées des individus ayant une exposition discrète sur une journée sous-tendent les estimations de la période d’incubation de la MVE utilisées dans la littérature de modélisation actuelle, et nous avons résumé les données empiriques suggérant que le temps de symptômes sous-estime le temps à l’infectiosité pour la MVE Ces résultats peuvent avoir des implications importantes pour les modèles de stratégies d’intervention contre la MVE

Remarques

Disclaimer Le contenu est uniquement de la responsabilité des auteurs et ne représente pas nécessairement les opinions officielles de l’Institut national des allergies et des maladies infectieuses NIAID, l’Institut national sur l’abus des drogues, l’Institut national des sciences médicales générales ou les National Institutes of Health NIHContributors Tous les auteurs ont conçu l’étude GEV, OA, EJL, EQM, et ID ont effectué la revue de la littérature Tous les auteurs ont contribué à la rédaction du manuscrit Soutien financier Ce travail a été soutenu par le NIAID [T AI à GEV]; l’Institut national d’abus des drogues [T DA à O A]; et l’Institut National des Sciences Médicales Générales aux conflits d’intérêts NIHPotential Tous les auteurs: Aucun conflit d’intérêt potentielTous les auteurs ont soumis le formulaire ICMJE pour la divulgation des Conflits d’intérêts potentiels Conflits que les éditeurs considèrent pertinents pour le contenu du manuscrit ont été divulgués